Toprağın Tuzluluğunun Artması: Yapay kimyasal gübrelerin içeriğindeki tuz miktarı yıllar içerisinde toprakta biriktikçe yüksek tuz konsantrasyonu hem toprağın yapısında hem de bitkisel verimde olumsuz durumlara neden olmaktadır.
• Ağır Metal Birikimi: Kimyasal gübrelerin içerisindeki kurşun, kadmiyum, arsenik, nikel ve bakır gibi toksik elementler doğaya bırakılmaktadır.
• Ötrofikasyon: Gübreler ile toprağa verilen azot ve fosfor gibi bileşikler bir şekilde sulara taşınınca sudaki bitkiler tarafından tüketilmekte bu durum su kalitesini düşürmekte ve sudaki diğer canlılar için yaşamı zorlaştırmaktadır.
• Nitrat Birikimi: Toprağa verilen nitratın fazlalığı ve bu bileşiğin sulara taşınması sonucu özellikle sularda artan nitrat, hem insanlarda hem de hayvanlarda düşük doğumları ile canlılığın azalmasına neden olmaktadır.
• Diğer Etkiler: Aşırı miktardaki azot bitkilerde kanserojen etki yapabilmekte, gübreler topraktaki besin dengesini bozabilmekte ve aşırı gübre topraktaki faydalı solucan